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FAIR-DATA management application stack for laboratory experiment
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River Hydraulics / Mage
OtherMAGE est un logiciel de simulation monodimensionnelle d'écoulement en rivière en régime transitoire. Son domaine d'application privilégié est la simulation des crues et des zones inondées. Les équations utilisées sont les équations de Saint-Venant.
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Simulation du transport de polluant et de sédiments fins en suspension (MES) dans un écoulement 1D. Ce code est couplé (couplage en cascade sans rétroaction) avec MAGE
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GEAPSI-Bioinfo / pipeline / specifics_alignmarkers
GNU Affero General Public License v3.0Still under development
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This repository contains the python code of the Marked-Release-Recapture simulator.
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urgi / URGI-Anagen / panREPET
CeCILL Free Software License Agreement v2.0panREPET is a pipeline detecting shared Transposable Element (TE) insertions among a pangenome. It takes in charge multiple de novo whole-genome assemblies of the same species. It compares TE copies between each pair of genomes then identifies TE copies shared by a group of individuals.
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Agroclim / Indicators / SEASON
GNU General Public License v3.0 or laterSystem for Evaluation of Agriculture faiSability using indicatOrs combiNation Système d’évAluatIon de la faiSabilité climatique des productiONs agricoles
Chaîne de traitement (sélection, calcul) d’indicateurs agroclimatiques sur un ensemble de points géographiques. Elle est utilisée en tant que telle ou pour le calcul des indicateurs dans SICLIMA.
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PFEM / Dev / Libraries / omerbio
MIT LicenseUpdated -
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MIAT-Com / Site web MIAT
MIT LicensePREVIEW : https://miat-com.pages-forge.inrae.fr/miat_website (Pour voir vos modifications après un commit, avant que ça ne soit validé)
ASSIGNEZ VOS MERGE REQUESTS à votre correspondant d'équipe/axe : @samuel.buchet (OpTeam), @leo.saulieres (DecA), @bcharlier (ASAP), @benjamin.linard (BioComp), @philippe.bordron (Genotoul) ou @rtrepos (RECORD)
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urgi / is / ontologies
Creative Commons Attribution Share Alike 4.0 InternationalOntologies
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bios4biol / DeFiS
GNU General Public License v3.0 or laterDeFIS is a pipeline for archeo-ichtyologists and biologists allowing the recognition of diadromous fishes with ancient DNA sample based metrics method (such as Kmers ratio and Jaccard index) between references sequences and the samples.
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TEMPO / Portail de données
GNU General Public License v3.0 or laterLe portail de données phénologiques du réseau TEMPO permet la recherche et le téléchargement de données issues de différentes sources ouvertes ou soumises à autorisation.
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Thomas Schiex / EffieDes
Creative Commons Attribution Non Commercial No Derivatives 4.0 InternationalUpdated