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Partie applicative d'AgroMetInfo.

SIDO (Système d’Information pour les Données Orphelines) est une application web qui permet de déposer les données récoltées par des sources de données orphelines, c'est-à-dire qui ne disposent pas de système d’information, dans une base de données dédiée.

MCQR is a comprehensive set of objects and function for R to handle MassChroQ results.

Series of tools to extract and plot MuSICA outputs

Projet de la version V2 de l'application des ORE.

Le projet est constitué de 2 sous projet :

La partie serveur qui fournit les web services de l'application

La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service

The Orfeo ToolBox (OTB) extension for Deep Learning. Enable the use of TensorFlow models on Remote Sensing images. Provides OTB applications for patches sampling, model training, model inference, hybrid models, and so on.

Site web de MIAT, avec wowchemy (hugo).

Pour voir vos modifications après un commit, la preview du site web est là : https://miat-com.pages.mia.inra.fr/miat_website

Assignez vos merges requests pour qu'elles soient passés sur le "vrai" site web, à votre correspondant d'équipe : @samuel.buchet, @gauthier.quesnel, @philippe.bordron ou @rtrepos

CDS THEIA MTD Software development kit. Documentation

metagWGS is a workflow dedicated to the analysis of metagenomic data. It allows assembly, taxonomic annotation, and functional annotation of predicted genes. Since release 2.3, binning step with the possibility of cross-alignment is included. It has been developed in collaboration with several CATI BIOS4biol agents. Funded by Antiselfish Project (Labex Ecofect), ExpoMicoPig project (France Futur elevage) and SeqOccIn project (CPER - Occitanie Toulouse / FEDER), ATB_Biofilm funded by PNREST Anses, France genomique (ANR-10-INBS-09-08) and Resalab Ouest.

Pipeline Nextflow

Angular interface of the Cassiopée software

Production version of Cassiopée is available at https://cassiopee.g-eau.fr

Fish migration monitoring, database connection and treatment

Scripts related with database development in stacomi.