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Shiny app for exploration and disambiguation of FROGS multi-affiliation

Documentation : https://hanna.bacave.pages.mia.inra.fr/odhmm/

Code to reproduce the results of "Non parametric OD-HMM"

backend

MAKAHO (pour MAnn-Kendall Analysis of Hydrological Observations) est un système de visualisation cartographique interactif permettant d’examiner les tendances présentes dans les données des stations hydrométriques aux débits peu influencés par les actions humaines. Le test de Mann-Kendall permet d’analyser la significativité des tendances de variables hydrologiques sur les différentes composantes du régime des cours d'eau (étiages, moyennes-eaux, crues), à mettre ensuite en relation avec les impacts du changement climatique sur l’hydrologie de surface.

https://makaho.sk8.inrae.fr

Replication repository for the article "A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data"

Implements in R the Rothamsted RothC package. Adds useful functions.

A shiny application that make time series events selection and modification simpler.

Lien vers l'application : https://crues-r.sk8.inrae.fr

https://biblio-tetis.sk8.inrae.fr

Mapping forest resource with LiDAR and NFI data in kanton Uri

Link to running app: https://matrixapp.sk8.inrae.fr

MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr. https://matrixapp.sk8.inrae.fr