Explore projects

Cette application permet l'exploration, l'interrogation, la visualisation et l’interprétation fonctionnelle d'un ensemble pre-processé de données épigénétiques (ATAC-seq) correspondant à la régulation temporelle des réseaux de transcription pendant la régénération des axones du système nerveux central chez le poisson zèbre.

https://rosetta.sk8.inrae.fr

ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.

https://explore-metabar.sk8.inrae.fr

Docs : https://optirrighive.pages-forge.inrae.fr/OptirrigCORE.api/dev/ Swagger : https://api.optirrig.g-eau.fr/__docs__/

https://optirrighive.pages.mia.inra.fr/OptirrigBEET

Decloud is a framework to remove clouds in Sentinel-2 images from joint Sentinel-1 (SAR) and Sentinel-2 (Optical) images or time series.

select or stitch the best image for each uplot and save it in "selected_images" directory

Bisulfite Sequencing Processing Software : Snakemake Pipeline