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Command line tool to compute volume of soil samples from images to estimate soil bulk density as in

Coulouma G, Feurer D, Vinatier F, Huttel O. Assessing new sensor-based volume measurement methods for high-throughput bulk density estimation in the field under various soil conditions. Eur J Soil Sci. 2021; 72: 2049–2061. https://doi.org/10.1111/ejss.13115

Base docker image for Rare project

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr

Atelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020

GfaViz as Appimage (no compilation needed)

Connecteur entre dataverse et jupyterhub

MAKAHO (pour MAnn-Kendall Analysis of Hydrological Observations) est un système de visualisation cartographique interactif permettant d’examiner les tendances présentes dans les données des stations hydrométriques aux débits peu influencés par les actions humaines. Le test de Mann-Kendall permet d’analyser la significativité des tendances de variables hydrologiques sur les différentes composantes du régime des cours d'eau (étiages, moyennes-eaux, crues), à mettre ensuite en relation avec les impacts du changement climatique sur l’hydrologie de surface.

https://makaho.sk8.inrae.fr

Project used to manage security for In-Sylva Information System

search.app is used by package search, and implement search processes

Used to manage account, policies and sources. Access reserved to insylva administrators and source managers

Notebooks Jupyter

L'application permet de simuler la dynamique spatio-temporelle de populations de moustiques Aedes (albopictus et aegypti) dans divers environnements et la dynamique de transmission de trois arboviroses : dengue, zika, chikungunya.

Lien vers l'application : https://arbocarto-r-app.sk8.inrae.fr