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MCQR is a comprehensive set of objects and function for R to handle MassChroQ results.

https://optirrighive.pages.mia.inra.fr/OptirrigBEET

a crop simulation model for sunflower

https://sunflo.pages-forge.inrae.fr/sunflower/

Docs : https://optirrighive.pages-forge.inrae.fr/OptirrigCORE.api/dev/ Swagger : https://api.optirrig.g-eau.fr/__docs__/

Application pédagogique : simulation des généalogies et coalescence en fonction de la taille efficace de la population et du nombre de séquences étudiées.

https://coalescent.sk8.inrae.fr

Application pédagogique : simulation des effets combinés de la sélection et de la dérive génétique sur l'évolution des fréquences alléliques dans une population en fonction de la taille efficace et de la valeur sélective des différents génotypes.

https://selection-derive.sk8.inrae.fr

Application pédagogique : simulation de l'effet de la sélection sur l'évolution de la fréquence des allèles à un locus au cours du temps, en fonction de la valeur sélective des différents génotypes.

https://selection.sk8.inrae.fr

Application pédagogique : simulation des effets combinés de la dérive génétique et de la migration entre populations sur l'évolution des fréquences alléliques de ces populations, en fonction de la taille efficace des populations et du taux de migration existant entre elles (Modèle en ile). Calcul du Fst entre ces populations.

https://fstat.sk8.inrae.fr

Application pédagogique : distribution des Fst simulés sous modèle neutre.

https://distrifst.sk8.inrae.fr

Application pédagogique : simulation de l'effet de la dérive génétique sur l'évolution des fréquences alléliques d'une population au cours du temps, en fonction de la taille efficace de la population.

https://derive.sk8.inrae.fr

https://explore-metabar.sk8.inrae.fr/

System for Evaluation of Agriculture faiSability using indicatOrs combiNation Système d’évAluatIon de la faiSabilité climatique des productiONs agricoles

Chaîne de traitement (sélection, calcul) d’indicateurs agroclimatiques sur un ensemble de points géographiques. Elle est utilisée en tant que telle ou pour le calcul des indicateurs dans SICLIMA.

This project is the source repository of the CRAN package 'SOMbrero' https://cran.r-project.org/package=SOMbrero.

The stochastic (also called on-line) version of the Self-Organising Map (SOM) algorithm is provided. Different versions of the algorithm are implemented, for numeric and relational data and for contingency tables as described, respectively, in Kohonen (2001) isbn:3-540-67921-9, Olteanu & Villa-Vialaneix (2005) doi:10.1016/j.neucom.2013.11.047 and Cottrell et al (2004) doi:10.1016/j.neunet.2004.07.010. The package also contains many plotting features (to help the user interpret the results), can handle (and impute) missing values and is delivered with a graphical user interface based on 'shiny'.