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ICEscreen detects and annotates ICEs (Integrative and Conjugative Elements) and IMEs (Integrative and Mobilizable Elements) in Firmicutes genomes.

RNAseq and EMseq analyses for the rosepigs project on stomach mucosa samples

https://ecoelec.pages.mia.inra.fr/communication/ecoelec

Nextflow pipeline creating a Neo4j Ortho_KB database.

planemo 4 SIWAA

Bisulfite Sequencing Processing Software : Snakemake Pipeline

STAC tools to simplify STAC use: local STAC creation, filter and process STAC ItemCollections (local and remote).

Documentation

Series of tools to extract and plot MuSICA outputs

R package to run MuSICA

Docker image with Intel Fortran Compiler (and some other dev tools).

Notebook for the Deep learning formation

Contains code to create and manage the SUDOANG rivers database

dbeel integration

Hosts the different implementation of EDA model

Application de reporting / datavisualisation qui a pour objectif de fournir une série d’indicateurs visuels et synthétiques représentatifs des volumes d’interventions sur les postes de secours ayant pris part au projet SWYM pour la collecte numérique de données via ODK.

https://smgbl-pcdep.sk8.inrae.fr

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr