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List of workflows (nextflow/snakemake) tested for Genotoul Cluster.

Retranscription d'audio en txt

Organisation d'un bootcamp autour de l'intégration et la visualisation de données avec Neo4J, adossé en amont d'une formation Neo4J en ligne.

Site web : https://work4graph.pages.mia.inra.fr/bootcamp-neo4j-2022/

Contribution à la réalisation du "pilote" INRAE, dans le cadre du programme européen GraspOS

Ajustement de différents modèles statistiques de courbes de réponse (réponse culture vs indicateur de disponibilité en éléments minéraux du sol).

Lien vers l'application : https://justep.sk8.inrae.fr

FROGS is a galaxy/CLI workflow designed to produce an OTUs count matrix from high depth sequencing amplicon data.

Project related to the development of a basket for RARe portal (https://urgi.versailles.inrae.fr/rare).

SHiNeMaS is a database with its web interface, dedicated to the management of the history of seed lots and related data like phenotyping, environment and cultural practices. SHiNeMaS is freely available under GNU Affero GPL Licence

Database connection utilities, RODBC and pool

R package to run MuSICA

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr