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Tutoriel pour le package R data.table.

Accompagne les supports de cours : https://elisemaigne.pages-forge.inrae.fr/2023-datatable/index.html.

Voir le README pour le lancement du tutoriel.

Le projet s'inscrit dans le cadre d'un stage de fin d'étude encadré par Marie-Lise BENOT, Maya GONZALES et Olivier LEPAIS du projet ECUME de BIOGECO INRAe. L'étude se porte sur la corrélation entre diversité génétique et diversité spécifique des communautés végétales dunaires le long du cordon dunaire atlantique (du Nord de la Gironde au Sud des Landes)

This project is the source repository of the CRAN package 'treediff' https://cran.r-project.org/package=treediff.

The R package treediff performs Hi-C data differential analysis based on pixel-level differential analysis and a post hoc inference strategy to quantify signal in clusters of pixels. Clusters of pixels are obtained through a connectivity-constrained two-dimensional hierarchical clustering.

Dépôt du site internet de la plateforme Genotoul-biostat

Beamer template for INRAE presentation. This is an unofficial template, inspired by the official ppt presentation template, provided as is and without any guarantee. Images remain the property of INRAE.

wiki for REPET usage

Fichiers supports pour le cours de Biomathématiques - MAM4 EPU Nice Sophia

Some scripts for the methylation analysis of the ChickStress project.

Contains code to create and manage the SUDOANG rivers database