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https://cmidoux.pages-forge.inrae.fr/slides/

Organisation d'un bootcamp autour de l'intégration et la visualisation de données avec Neo4J, adossé en amont d'une formation Neo4J en ligne.

Site web : https://work4graph.pages.mia.inra.fr/bootcamp-neo4j-2022/

This repository is a toolbox for PFEM's GitLab projects: templates for README, CI/CD, docker images, ...

Life game (Conway) using vle::discrete_time cells and vle.generic.builder Builder model to generate cells and their connexions

Replication repository for the article "A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data"

X!TandemPipeline is a free software (GPL v3) that helps you to filter and group your peptide/protein identifications from MS/MS mass spectra.

Publication: J. Proteome Res. 2017, 16, 2, 494–503 -- https://doi.org/10.102

Site web pour une école thématique interdisciplinaire Inrae

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr

https://mahendra-mariadassou.pages.mia.inra.fr/jc2bim2024/

Présentation en ligne sur GitLab Pages

Code storage Area of the RECORD Project packages.

Présentation en ligne sur GitLab Pages inspiré par Formation INRAE PACA

Project related to the development of a basket for RARe portal (https://urgi.versailles.inrae.fr/rare).

Link to running app: https://matrixapp.sk8.inrae.fr

MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr. https://matrixapp.sk8.inrae.fr