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Server : https://shiny.migale.inrae.fr/app/easy16S | Doc : https://easy16s.migale.inrae.fr/

Java library for metabolic networks

Pipeline used to tranfert gene annotation (GFF3) between different versions of assemblies.

Atelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr

Link to running app: https://matrixapp.sk8.inrae.fr

MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr. https://matrixapp.sk8.inrae.fr

Docs : https://optirrighive.pages-forge.inrae.fr/OptirrigCORE.api/dev/ Swagger : https://api.optirrig.g-eau.fr/__docs__/

What is “OptirrigCORE.api” package ?

OptirrigCORE.api is a small R package that turns the core functions of OptirrigCORE into a web service. Built on top of Plumber, it makes it possible to start projects, load configurations, prepare simulation inputs, run irrigation models and retrieve results—all over HTTP instead of inside an R session.

Application de reporting / datavisualisation qui a pour objectif de fournir une série d’indicateurs visuels et synthétiques représentatifs des volumes d’interventions sur les postes de secours ayant pris part au projet SWYM pour la collecte numérique de données via ODK.

https://smgbl-pcdep.sk8.inrae.fr

planemo 4 SIWAA

https://optirrighive.pages.mia.inra.fr/OptirrigBEET