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SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.

https://samba.sk8.inrae.fr/

Un outil d’aide à la décision (indicateurs, analyses des indicateurs) pour une meilleure gestion des risques associés aux ongulés sauvages, plus particulièrement les dégâts causés par les ongulés sauvages sur la régénération forestière. Collaboration avec l’OFB pour répondre à un besoin des gestionnaires et des décideurs, mais également en réponse à la fiche d’action 4.3 issue des assises de la forêt et du bois.

https://barometre-national-foret-ongules.sk8.inrae.fr

PlantBreedGame est un logiciel mettant en place un serious game pour enseigner la sélection via l'exemple d'une espèce végétale annuelle fictive à des étudiants de niveau master.

https://plant-breed-game.sk8.inrae.fr

Edition 2026 de la journée SHINY::INRAE - 28 janvier 2026 https://sk8.pages-forge.inrae.fr/journee_shiny_inrae/edition_2026

LESSEM internal package for simulation of forest dynamic depending on climatic variables

LESSEM internal package for simulation of forest dynamic depending on climatic variables

Annotation pipeline (transform SGBDR/CSV data to rdf)

https://abarnabe.pages-forge.inrae.fr/slides/

Supports pour la formation shiny - Plateforme de Biostatistique – Génopole Toulouse Midi-Pyrénées

Supports : https://elisemaigne.pages-forge.inrae.fr/formation-shiny/

F3MR is a R package that help to analyze food microbiome omics data based on dedicated and curated metabolic modules based on extensive literature review. It belongs to F3M software suite developed by INRAE Food Microbial Ecology lab

Fish migration monitoring, database connection and treatment

Pan1c: a Snakemake workflow to build chromosome level pangenomes.