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Visualisation de données métagénomiques.

Harvest and index meta data from BrAPI endpoints for data access through the plant-faidare data lookup portal (https://github.com/elixir-europe/plant-faidare).

This project is the entrypoint for an Information System dedicated to manage a forest experimentation metadata catalog. It relies on a metadata standard available at URL https://data.inrae.fr/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.15454/ELXRGY.

Project used to manage security for In-Sylva Information System

search.app is used by package search, and implement search processes

Docs : https://optirrighive.pages-forge.inrae.fr/OptirrigCORE.api/dev/ Swagger : https://api.optirrig.g-eau.fr/__docs__/

Image Docker pour CI/CD de la documentation avec Hugo.

Pipeline used to tranfert gene annotation (GFF3) between different versions of assemblies.

Landscape Epidemiology and Evolution R package

Docs

CRAN

Shiny app || Shiny Multi app

Server : https://shiny.migale.inrae.fr/app/easy16S | Doc : https://easy16s.migale.inrae.fr/

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr