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R package to run MuSICA

Exploitation et maintenance du thésaurus INRAE, thésaurus ouvert et partagé couvrant les domaines de recherche d’INRAE. Il sert de référentiel au sein de l’institut pour indexer et annoter des documents, pages web, descriptions d’activités, jeux de d

F3MR is a R package that help to analyze food microbiome omics data based on dedicated and curated metabolic modules based on extensive literature review. It belongs to F3M software suite developed by INRAE Food Microbial Ecology lab

part of the ANR D2KAB project, this repository is dedicated to the construction of semantic resources (RDF dataset and OWL ontologies) that will represent plant phenological development stages for agricultural practices.

Le portail de données phénologiques du réseau TEMPO permet la recherche et le téléchargement de données issues de différentes sources ouvertes ou soumises à autorisation.

STAC tools to simplify STAC use: local STAC creation, filter and process STAC ItemCollections (local and remote).

Documentation

SIDO (Système d’Information pour les Données Orphelines) est une application web qui permet de déposer les données récoltées par des sources de données orphelines, c'est-à-dire qui ne disposent pas de système d’information, dans une base de données dédiée. tickets

This project is the source repository of the CRAN package 'SOMbrero' https://cran.r-project.org/package=SOMbrero.

The stochastic (also called on-line) version of the Self-Organising Map (SOM) algorithm is provided. Different versions of the algorithm are implemented, for numeric and relational data and for contingency tables as described, respectively, in Kohonen (2001) isbn:3-540-67921-9, Olteanu & Villa-Vialaneix (2005) doi:10.1016/j.neucom.2013.11.047 and Cottrell et al (2004) doi:10.1016/j.neunet.2004.07.010. The package also contains many plotting features (to help the user interpret the results), can handle (and impute) missing values and is delivered with a graphical user interface based on 'shiny'.

Pipeline Nextflow

A package build on top of airGRiwrm containing helper functions for pre-processing data and vignettes with a complete example of an integrated hydrological model setup from scratch and publicly available data.

A Python scripting interface for CB-Geo MPM