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MIA-PS / réduction de dimension / prob_dim_red
MIT LicenseUpdated -
Marianne Defresne / Emmental PLL
MIT LicenseUpdated -
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Nextflow pipeline to extract syntenic blocks using the MCScanX program.
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BioMa component of the phenology model in SiriusQuality2
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Supports pour la formation shiny - Plateforme de Biostatistique – Génopole Toulouse Midi-Pyrénées
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Omnicrobe / Omnicrobe database
Apache License 2.0Updated -
David Allouche / jobarray
MIT Licensejob array allows managing list of jobs execution across sge and PBS scheduler system. each job is considered as an independent task. DAG management is also possible by defining constraints between job array
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SCALES / Differential analysis of trees
GNU Affero General Public License v3.0Repository code for the article: Neuvial Pierre, Randriamihamison Nathanaël, Chavent Marie, Foissac Sylvain, and Vialaneix Nathalie (2023) A two-sample tree-based test for hierarchically organized genomic signals. Preprint.
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FormationCalcul2023 / formation-linux
Creative Commons Attribution Share Alike 4.0 InternationalUpdated -
SCALES / Replication repository for Chrocodiff
GNU General Public License v3.0 or laterReplication repository for the article "A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data"
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Un outil d’aide à la décision (indicateurs, analyses des indicateurs) pour une meilleure gestion des risques associés aux ongulés sauvages, plus particulièrement les dégâts causés par les ongulés sauvages sur la régénération forestière. Collaboration avec l’OFB pour répondre à un besoin des gestionnaires et des décideurs, mais également en réponse à la fiche d’action 4.3 issue des assises de la forêt et du bois.
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metribo / snoboard-client
GNU General Public License v3.0 or laterUpdated