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Electron Desktop App For Bisulfite Sequencing Processing Software (BiSePS)

Contribution à la réalisation du "pilote" INRAE, dans le cadre du programme européen GraspOS

This project is the source repository of the CRAN package 'hicream' https://cran.r-project.org/package=hicream.

It performs Hi-C data differential analysis based on pixel-level differential analysis and a post hoc inference strategy to quantify signal in clusters of pixels. Clusters of pixels are obtained through a connectivity-constrained two-dimensional hierarchical clustering.

Contains code to create and manage the SUDOANG rivers database

Base docker image for Rare project

Some scripts for the methylation analysis of the ChickStress project.

Site web pour une école thématique interdisciplinaire Inrae

Some scripts for the methylation analysis of the ChickStress project.

SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.

https://samba.sk8.inrae.fr/

GfaViz as Appimage (no compilation needed)