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Le projet s'inscrit dans le cadre d'un stage de fin d'étude encadré par Marie-Lise BENOT, Maya GONZALES et Olivier LEPAIS du projet ECUME de BIOGECO INRAe. L'étude se porte sur la corrélation entre diversité génétique et diversité spécifique des communautés végétales dunaires le long du cordon dunaire atlantique (du Nord de la Gironde au Sud des Landes)

job array allows managing list of jobs execution across sge and PBS scheduler system. each job is considered as an independent task. DAG management is also possible by defining constraints between job array

App Nextcloud permettant de publier des fichiers du Nextcloud INRAE vers DataINRAE

SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.

https://samba.sk8.inrae.fr/

shinySbm is a package containing a shiny application. This application is build for network analysis based on the sbm package made by Chiquet J, Donnet S and Barbillon P (2023) CRAN. It allow to apply and explore the outputs of a Stochastic Block Model. It is useful if you want to analyse your data (could be adjacency matrix or edges list) without R language knowledge or to learn the basic lines of the sbm package.

Présentation en ligne sur GitLab Pages

Dépôt du site internet de la plateforme Genotoul-biostat

Connecteur entre dataverse et jupyterhub

https://optirrighive.pages.mia.inra.fr/OptirrigBEET

Gestion des collections d'échantillon - management of samples collections