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A project to try things, to test...

Une page présentant les analyses génétiques d'arbres échantillonnés forêt de Chantilly. https://bbrachi.pages.mia.inra.fr/chantilly/

Projet de la version V2 de l'application des ORE.

Le projet est constitué de 2 sous projet :

La partie serveur qui fournit les web services de l'application

La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service

Fork of the omnicrobe extended microorganisms taxonomy repository used to explore the alignments between NCBI and EPPO taxonomies.

Flask website

R'MES is a tool for studying word frequencies in biological sequences.

Analysis of Sterile-Insect Technique Mark-Release-Recapture and pilot population-suppression trial data from Indonesia. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-indonesia/

Work during my internship at IRHS. A new method of visualization for displaying metadata changes in an iterative biclustering algorithm

erecord web services, web solutions for VLE models of RECORD platform

Application python pour controler la conformité d'un fichier json en fournissant un schéma json.

Tropolink backend (API)

Rnem permet de simuler les dynamiques des interactions entre nématodes phytoparasites (nématodes à galles) et système racinaire des plantes. L'évolution de la virulence des nématodes face à des rotations de cultivars résistants et sensibles est une des applications principales.

Lien vers l'application : https://rnem.sk8.inrae.fr

L'application template de base.

simple : https://sk8-demo.sk8.inrae.fr

catalogue : https://shiny.sk8.inrae.fr/app/sk8-demo

https://owa.sk8.inrae.fr

Présentation technique : Options pour la validation des cartes nationales des risques à l’aide des données nationales de surveillance. F Muñoz, R Lancelot (CIRAD). https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/presentations/2022_fao_risk-validation

Codes didactiques pour manipuler les notions de période de retour des crues, avec texte explicatif sur le wiki. Ces codes ont servi à illustrer le billet de blog "La « crue centennale » prise la main dans le sac !" de l'association EauDyssée, à destination du grand public. Le développement se poursuit en parallèle en anglais (projet "bag of floods").

Guidelines pour modèles mixtes

L'application permet, à partir de données de mortalité en élevage de volailles rentrées par l'utilisateur, de calculer les dates les plus probables de la première infection par un virus influenza aviaire hautement pathogène. L'application est basée sur un modèle épidémiologique classique de type SEIR, et l'estimation de la date de la première infection utilise un algorithme d'Approximate Bayesian Computation.

Lien d'accès à l'application https://first-inf.sk8.inrae.fr

"beads" (billes en Français) est un logiciel de détection et de quantification de spots sur des images de gels d'électrophorèse bidimensionnelle.