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Implementation of the deterministic model of the intestinal including microbiota, as described in Darrigade et al., 'A PDMP model of the epithelial cell turn-over in the intestinal crypt including microbiota-derived regulations.' (2021).

Analysis of Sterile-Insect Technique Mark-Release-Recapture and pilot population-suppression trial data from Indonesia. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-indonesia/

Template for data-analysis projects using R and targets.

Comparison of scaling procedures for the assessment of the risk of introduction in the context of the EuFMD project. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/stage_mlegray/

Benchmark second and third generation sequencing technologies on 3 synthetic microbial communities

Documents des cours

Méthodes de preuves, optimisation et satisfaction de contraintes (MPOSC) M2R IA, UPS Toulouse. Modélisation probabiliste et Algorithmes pour la Biologie (MAB) M2R IA, UPS Toulouse. Graphes et réseaux, SupAero Toulouse.

Datapaper describing dataverse collection on RMQS1 microbiological dataset (The French Soil Quality Monitoring Network). https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse/rmqs_microbio

Projet Difuse Activite 1: Caractérisation de la diversité des pratiques et des points de vue des acteurs manifestant leur volonté de s’engager dans le changement face aux urgences socio-écologiques au sein la Recherche Pour le Développement.

R package for recovering and preparing useful data for damage appraisal in a French context

Materials for ENAC course on graphs and networks. It contains slides and practical exercices for the course. A list of past exams is also available.

Deuxième atelier régional du projet PRAPS II. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/training/praps2-atelier2.

Support de présentation pour les sessions de formation bases de Linux et bonnes pratiques de développement informatique

Projet pour élaborer le support de présentation du projet CANULAR. Le document est en LaTeX et le CI/CD permet de générer directement un fichier PDF.

Validation of a qualitative risk assessment of Foot-and-Mouth Disease in Tunisia with observed data. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/fmd_risk_validation/