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version de Mai 2023
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Instructions pour Windows 10
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# Installation de QuPath (v0.4.3)
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## Téléchargement de QuPath
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* Télécharger la version la plus récente de QuPath (actuellement 0.4.3) sur le site : https://qupath.github.io/
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* Cliquez ssur le bouton jaune "Download for Windoows". Un fichier .msi se télécharge.
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**Note** : Vous trouverez à cette adresse un liste des problèmes éventuels que vous pouvez rencontrer et comment les régler : https://qupath.readthedocs.io/en/stable/docs/intro/installation.html
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## Installation de Qupath
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* Double cliquer sur le fichier .msi téléchargé.
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* Installer QuPath en suivant les indications (laissez les paramètres par défaut). Si vous passez par l’installateur QuPath s’installera dans C:\Users\VOTRE NOM D'UTILISATEUR\QuPath
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**Note** : Plusieurs version de QuPath peuvent cohabiter.
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# Installation de l’extension StarDist (v0.4.0)
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## Téléchargement de l’extension StarDist pour QuPath
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* Vous trouverez le plugin à cette adresse : https://github.com/qupath/qupath-extension-stardist/releases
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* Télécharger le fichier "qupath-extension-stardist-0.4.0.jar" en cliquant sur le lien correspondant.
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## Installation de l’extension
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Pour installer le plugin StarDist dans QuPath :
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* Ouvrez QuPath
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* Une fois dans le logiciel : glissez-déposezl’extension "qupath-extension-stardist-0.4.0.jar" préalablement téléchargée.
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* Vous serez informé (en bas à droite du logiciel) que l’extension à bien été installée par le message "extension loaded".
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* Vous pouvez contrôler l’installation de l’extension via le menu Extensions. Un sous menu "Stardist" est apparu.
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# Téléchargement des modèles pré-entrainés de StarDist
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* Vous trouvez les 3 modèles pré-entrainés à cette adresse : https://github.com/qupath/models/tree/main/stardist#downloads
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* Téléchargez-les dans un dossier de votre choix sur votre ordinateur en cliquant sur les lien correspondant :
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* <font color='blue'>dsb2018_heavy_augment.pb</font>
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* <font color='blue'>dsb2018_paper.pb</font>
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* <font color='blue'>he_heavy_augment.pb</font> |
