... | ... | @@ -132,7 +132,7 @@ Pour installer le plugin StarDist dans QuPath : |
|
|
```
|
|
|
modelPath = "C:/Users/mcblache/Documents/models/stardist/dsb2018_heavy_augment.pb
|
|
|
```
|
|
|
* Modifier la ligne channels :
|
|
|
* Modifier la ligne 28 :
|
|
|
* Remplacer 'DAPI' par 'Channel 1'.
|
|
|
|
|
|
```
|
... | ... | @@ -142,7 +142,7 @@ Pour installer le plugin StarDist dans QuPath : |
|
|
* Réalisation d'une petite annotation :
|
|
|
* Choisir l'outil : rectangle <img src="./illustration/outilrectangle.png" width="30" height="30">
|
|
|
* Dessiner un petit carré sur l'image englobant des objets à segmenter
|
|
|
* Le carré doit être jaune (selectionné)
|
|
|
* Assurez-vous de sélectionner le carré précédemment tracé (les contours du carré doivent apparaître en jaune)
|
|
|
* Exécuter le script groovy :
|
|
|
* Dans la fenêtre "Script Editor", Run → Run
|
|
|
* Des sélections autour des noyaux doivent apparaître sur l'image.
|
... | ... | |