| ... | ... | @@ -54,16 +54,15 @@ l’application que les nouveaux plugins sont pris en compte. |
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* Vérifier dans le menu la présence : **Plugins → MiC → Mask instant Comparator**
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## Vérification des installations sous Fiji pour utiliser le plugin StarDist
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* Ouvrir Fiji
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## Vérification des installations sous FIJI pour utiliser le plugin StarDist
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* Ouvrir FIJI
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* Télécharger l'image : [Nuclei_DSB2018.tif](https://forgemia.inra.fr/gt-maiia/mifobio_stardist/-/blob/main/images/Nuclei_DSB2018.tif)
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* Ouvrir l'image dans Fiji: **File → Open** ou Glisser-Déposer l'image dans l'interface Fiji
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* Lancer le plugin StarDist: **Plugins → StarDist → StarDist 2D**
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* Choisir les paramètres par défaut sur l'interface et sélectionner output Type: Both (affichage des régions d'intérêts et création d'une image avec les labels détectés)
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* Appuyer sur le bouton "Ok" pour démarrer la segmentation des noyaux avec StarDist sur l'image
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<img src="./illustration/StarDist_NucleiDSB2018.png" width="1000" height="800">
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<img src="./illustration/StarDist_NucleiDSB2018.png" width=95%>
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# QuPath (v0.4.3)
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