... | ... | @@ -57,7 +57,7 @@ l’application que les nouveaux plugins sont pris en compte. |
|
|
## Vérification des installations sous Fiji pour utiliser le plugin StarDist
|
|
|
* Ouvrir Fiji
|
|
|
* Télécharger l'image : [Nuclei_DSB2018.tif](https://forgemia.inra.fr/gt-maiia/mifobio_stardist/-/blob/main/images/Nuclei_DSB2018.tif)
|
|
|
* Ouvrir l'image dans Fiji
|
|
|
* Ouvrir l'image dans Fiji: **File → Open** ou Glisser-Déposer l'image dans l'interface Fiji
|
|
|
* Lancer le plugin StarDist: **Plugins → StarDist → StarDist 2D**
|
|
|
|
|
|
<img src="./illustration/StarDist_NucleiDSB2018.png" width="1000" height="800">
|
... | ... | @@ -87,7 +87,7 @@ l’application que les nouveaux plugins sont pris en compte. |
|
|
## Installation de l’extension
|
|
|
|
|
|
Pour installer le plugin StarDist dans QuPath :
|
|
|
* Ouvrez QuPath
|
|
|
* Ouvrir QuPath
|
|
|
* Une fois dans le logiciel : glissez-déposez l’extension "qupath-extension-stardist-0.4.0.jar" préalablement téléchargée.
|
|
|
* Vous serez informé (en bas à droite sur QuPath) que l’extension à bien été installée par le message "extension loaded".
|
|
|
* Vous pouvez contrôler l’installation de l’extension via le menu Extensions. Un sous-menu "StarDist" est apparu.
|
... | ... | |