cohérence des noms de paramètres banques (db et bank)
Suggestion de conserver la même nommenclature pour tous les noms de paramètres similaires.
En l'occurrence pour les path vers les banques on a :
-
kaiju_db
,kaiju_db_dir
&eggnog_mapper_db
-
diamond_bank
checkm2_bank
gtdbtk_bank
mash_bank
-
taxdump
&accession2taxid
Peut être pourrait-on homogénéiser ?
Par ailleurs a t on vraiment besoins de 2 paramètres kaiju (#281) ?
Edited by Maria Bernard