BUG: remove plink formats from apt-format-results command and replace with PLINK

Sophie à identifié que les PED générés par apt-format-results ne semble pas correctes.

On va remplacer la commande apt-format-results par une conversion avec plink du VCF

 plink --vcf TaBW420k_AxiomGT1.OTV.vcf --vcf-idspace-to '_' --double-id  --allow-extra-chr --make-bed --out
 plink --vcf TaBW420k_AxiomGT1.vcf --vcf-idspace-to '_' --double-id  --allow-extra-chr --make-bed --out