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part of the ANR D2KAB project, this repository is dedicated to the construction of semantic resources (RDF dataset and OWL ontologies) that will represent plant phenological development stages for agricultural practices.

metagWGS is a workflow dedicated to the analysis of metagenomic data. It allows assembly, taxonomic annotation, and functional annotation of predicted genes. Since release 2.3, binning step with the possibility of cross-alignment is included. It has been developed in collaboration with several CATI BIOS4biol agents. Funded by Antiselfish Project (Labex Ecofect), ExpoMicoPig project (France Futur elevage) and SeqOccIn project (CPER - Occitanie Toulouse / FEDER), ATB_Biofilm funded by PNREST Anses, France genomique (ANR-10-INBS-09-08) and Resalab Ouest.

Stage BUT3

mechanistic-statistical environment

https://msegrp.pages-forge.inrae.fr/mse

A package build on top of airGRiwrm containing helper functions for pre-processing data and vignettes with a complete example of an integrated hydrological model setup from scratch and publicly available data.

Python code to map metabolites (including lipids) to metabolic networks using ontology.

Un outil d’aide à la décision (indicateurs, analyses des indicateurs) pour une meilleure gestion des risques associés aux ongulés sauvages, plus particulièrement les dégâts causés par les ongulés sauvages sur la régénération forestière. Collaboration avec l’OFB pour répondre à un besoin des gestionnaires et des décideurs, mais également en réponse à la fiche d’action 4.3 issue des assises de la forêt et du bois.

https://barometre-national-foret-gibier.sk8.inrae.fr

FAIDARE: FAIR Data-finder for Agronomic Research

It provides web services (based on the BrAPI standard) and a web interface with easy to use filters to facilitates the access to plant datasets from a federation of sources.

Site web du projet SONAR (Synthèse des dOnnées bioéconomiques et iNdicateurs trAnsitions des territoires uRbains) du métaprogramme BETTER https://better.hub.inrae.fr/

STAC extensions schemas

Site web de MIAT, avec wowchemy (hugo).

Pour voir vos modifications après un commit, la preview du site web est là : https://miat-com.pages-forge.inrae.fr/miat_website

Assignez vos merges requests pour qu'elles soient passés sur le "vrai" site web, à votre correspondant d'équipe : @samuel.buchet, @gauthier.quesnel, @philippe.bordron ou @rtrepos