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Produce an epidemiological risk map by weighting multiple risk factors. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/mapMCDA/

Tutoriel pour le package R data.table.

Accompagne les supports de cours : https://elisemaigne.pages-forge.inrae.fr/2023-datatable/index.html.

Voir le README pour le lancement du tutoriel.

Outil d'interrogation PO²

Application de reporting / datavisualisation qui a pour objectif de fournir une série d’indicateurs visuels et synthétiques représentatifs des volumes d’interventions sur les postes de secours ayant pris part au projet SWYM pour la collecte numérique de données via ODK.

https://smgbl-pcdep.sk8.inrae.fr

https://metatoul.pages.mia.inra.fr/graphstats

Sylvaclim prototype app

https://bios4biol.pages.mia.inra.fr/training-aln-variant-calling

DRAP is a De novo Rna Assembly Pipeline allowing to clean and filter RNA-seq De novo assemblers results to get the most compact and complete set of transcripts.

Supports pour la formation shiny - Plateforme de Biostatistique – Génopole Toulouse Midi-Pyrénées

Docs : https://optirrighive.pages.mia.inra.fr/OptirrigCORE

What is “OptirrigCORE” package ? The OptirrigCORE package in R is based on the Optirrig model. It facilitates the extraction and formatting of observation data used by the model, as well as the integration of plant, soil and yield descriptions. It supports various analytical methods, such as Ex-Post and Ex-Ante analyses, with a view to drawing up an optimised irrigation schedule based on the criteria. The package includes all the calculation tools needed to describe biophysical processes with a generalist approach. It can be used as a dependency or complement to modify and reinterpret biophysical descriptions. What’s more, it automates the modeling process, the description of biophysical processes and the analysis of results and performance, guaranteeing a reproducible approach. It also makes it easy to compile results in automated reports.

Un outil d’aide à la décision (indicateurs, analyses des indicateurs) pour une meilleure gestion des risques associés aux ongulés sauvages, plus particulièrement les dégâts causés par les ongulés sauvages sur la régénération forestière. Collaboration avec l’OFB pour répondre à un besoin des gestionnaires et des décideurs, mais également en réponse à la fiche d’action 4.3 issue des assises de la forêt et du bois.

https://barometre-national-foret-ongules.sk8.inrae.fr

job array allows managing list of jobs execution across sge and PBS scheduler system. each job is considered as an independent task. DAG management is also possible by defining constraints between job array

Partie applicative d'AgroMetInfo.

𝐂𝐀𝐖𝐄𝐓 (Calculation of Agronomical Water needs and EvapoTranspiration) is an open-source tool for automatic estimation of agricultural water needs

Site web pour une école thématique interdisciplinaire Inrae