Explore projects

Projet de la version V2 de l'application des ORE.

Le projet est constitué de 2 sous projet :

La partie serveur qui fournit les web services de l'application

La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service

Server : https://shiny.migale.inrae.fr/app/easy16S | Doc : https://easy16s.migale.inrae.fr/

Java library for metabolic networks

Pipeline used to tranfert gene annotation (GFF3) between different versions of assemblies.

Scripts related with database development in stacomi.

SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.

https://samba.sk8.inrae.fr/

Visualisation de données métagénomiques.

GfaViz as Appimage (no compilation needed)

Harvest and index meta data from BrAPI endpoints for data access through the plant-faidare data lookup portal (https://github.com/elixir-europe/plant-faidare).

shinySbm is a package containing a shiny application. This application is build for network analysis based on the sbm package made by Chiquet J, Donnet S and Barbillon P (2023) CRAN. It allow to apply and explore the outputs of a Stochastic Block Model. It is useful if you want to analyse your data (could be adjacency matrix or edges list) without R language knowledge or to learn the basic lines of the sbm package.

Atelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020