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VANRENTERGHEM Théodore / ShinySbm
MIT LicenseshinySbm is a package containing a shiny application. This application is build for network analysis based on the sbm package made by Chiquet J, Donnet S and Barbillon P (2023) CRAN. It allow to apply and explore the outputs of a Stochastic Block Model. It is useful if you want to analyse your data (could be adjacency matrix or edges list) without R language knowledge or to learn the basic lines of the sbm package.
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SK8 / sk8-apps / ETTIS / ShinyIDEA
GNU General Public License v3.0 onlyShinyIDEA permet d'insérer un fichier de données issues de la méthode IDEA4 et de visualiser des premiers résultats synthétiques avant d'exporter des rapports complets sous différents formats. https://shinyidea.sk8.inrae.fr
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inter_CATI_omics / Hackathon_octobre2021 / ShinyDataScience
GNU General Public License v3.0 onlyUpdated -
SATLAND is an application to detect and characterize hotspots of change. It is based on Python libraries (xarray, Bfast, rasterio for back-end, Streamlit for Front-End)
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SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.
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lisc / R package Cantal
GNU General Public License v3.0 onlyR-package to investigate the effects of drying event on metacommunity dynamics in dendritic river networks.
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Cette application permet l'exploration, l'interrogation, la visualisation et l’interprétation fonctionnelle d'un ensemble pre-processé de données épigénétiques (ATAC-seq) correspondant à la régulation temporelle des réseaux de transcription pendant la régénération des axones du système nerveux central chez le poisson zèbre.
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Package R with a shiny interface to run an interactive differential gene/region expression analysis.
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L'application rflomics est un package R couplé à une interface shiny permettant la gestion, l'analyse et l'intégration statistique de plusieurs jeux et types de données -omics: RNAseq, proteomics et metabolomics (pour le moment).
Lien vers l'application : https://rflomics.sk8.inrae.fr
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UMR G-EAU / RADIS.api
GNU Affero General Public License v3.0Updated -
UMR G-EAU / RADIS
GNU Affero General Public License v3.0RADIS - Retrieve Agronomic Data in a Sector, R package support : https://umr-g-eau.pages-forge.inrae.fr/radis
The radis package aims to facilitate the extraction of environmental data from various cartographic or spatial sources or APIs. It allows for the retrieval of this information using specific spatial shape. This package also formats the extracted data in a way that makes it easily exploitable for further analysis.
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