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This repository contains various sources for INRAE documents in LaTeX:

Beamer template for INRAE presentation. This is an unofficial template, inspired by the official ppt presentation template, provided as is and without any guarantee. Images remain the property of INRAE.

CSS files. They include several unofficial templates, without the original comment and inspired by CSS report files (évaluations et annexes).

Server : https://shiny.migale.inrae.fr/app/easy16S | Doc : https://easy16s.migale.inrae.fr/

A static web site to present the team

https://cmidoux.pages-forge.inrae.fr/slides/

Retranscription d'audio en txt

Source code of BIP software (Biological Image Processing)

https://mahendra-mariadassou.pages.mia.inra.fr/jc2bim2024/

https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-methods/

Replication repository for the article "A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data"

Formation (supports de cours et TP) sur l'analyse statistique de données RNA-seq Formation proposée par la plateforme Genotoul-Bioinfo

Hosts the different implementation of EDA model

LESSEM internal package for simulation of forest dynamic depending on climatic variables

Source code of BIP software (Biological Image Processing)

https://elisemaigne.pages.mia.inra.fr/slides/surapprentissage/

Datapaper describing dataverse collection on RMQS1 microbiological dataset (The French Soil Quality Monitoring Network). https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse/rmqs_microbio

AWDV : Activity Wheel Data Visualizer un programme pour l'analyse des données ACTIVYWHEEL sur le long terme et la visualisation des rythmes d'activité.

{AWDV: Activity Wheel Data Visualizer - A Program for Long-Term ACTIVITYWHEEL Data Analysis and Activity Rhythm Visualization}## Nom du logiciel

ActivityWheelDataVisualizer AWDV

Ce programme vise a pour but le regroupement et la présentation des données d'activité des souris enregistrées par le logiciel ACTIVYWHEEL.

a running wheel (23 cm diameter, Intellibio, Seichamps, France).

Spécifité du logiciel présenté

analyse long terme sur plusieurs enregistrements et possibilité d'exclure des jours en fonction des urrégularités d'enregistrement (erreurs ou interventions) et ajout des rythmes d'activité.

ShinyQSort est une application permettant un recueil de données selon la méthodologie QSort pour le classement subjectif d'opinions et de points de vues. L'application propose également des sorties d'analyse individuelle et collectives sous forme de rapports PDF.

https://shinyqsort.sk8.inrae.fr