Explore projects

Exploration interactive de scenario de simulation du modèle MF1.2-1ha du projet Atcha.

https://mf-12-1-ha.sk8.inrae.fr/ | https://shiny.sk8.inrae.fr/app/atcha-mf-12-1-ha | https://shiny.sk8.inrae.fr/app_direct/atcha-mf-12-1-ha

Infer parameters of epidemic and phylodynamic models using Neural Posterior Estimation

SATLAND is an application to detect and characterize hotspots of change. It is based on Python libraries (xarray, Bfast, rasterio for back-end, Streamlit for Front-End)

Un outil d’aide à la décision (indicateurs, analyses des indicateurs) pour une meilleure gestion des risques associés aux ongulés sauvages, plus particulièrement les dégâts causés par les ongulés sauvages sur la régénération forestière. Collaboration avec l’OFB pour répondre à un besoin des gestionnaires et des décideurs, mais également en réponse à la fiche d’action 4.3 issue des assises de la forêt et du bois.

https://barometre-national-foret-ongules.sk8.inrae.fr

Perl extension for fragment annotation in metabolomics

Comment sauvegarder/exporter ses messages Mattermost

Scripts related with database development in stacomi.

Docs : https://optirrighive.pages-forge.inrae.fr/OptirrigCORE.api/dev/ Swagger : https://api.optirrig.g-eau.fr/__docs__/

Connecteur entre dataverse et jupyterhub

Atelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020

Command line tool to compute volume of soil samples from images to estimate soil bulk density as in

Coulouma G, Feurer D, Vinatier F, Huttel O. Assessing new sensor-based volume measurement methods for high-throughput bulk density estimation in the field under various soil conditions. Eur J Soil Sci. 2021; 72: 2049–2061. https://doi.org/10.1111/ejss.13115

shinySbm is a package containing a shiny application. This application is build for network analysis based on the sbm package made by Chiquet J, Donnet S and Barbillon P (2023) CRAN. It allow to apply and explore the outputs of a Stochastic Block Model. It is useful if you want to analyse your data (could be adjacency matrix or edges list) without R language knowledge or to learn the basic lines of the sbm package.

Base docker image for Rare project

SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.

https://samba.sk8.inrae.fr/

GfaViz as Appimage (no compilation needed)