biom2phyloseq.R ($205) · Snippets · GitLab

gitlab.irstea.fr: clap de fin

Après 10 ans de bons et loyaux services, la forge institutionnelle de feu Irstea baissera le rideau le 30 juin 2026 prochain Nous vous invitons donc à migrer tous vos projets sur la forge institutionnelle INRAE. Il n'est malheureusement pas possible de migrer automatiquement tous les projets. Toutefois l'équipe de la forge a testé différents scénarios de migration et a redigé un guide de migration

Cedric Midoux @cmidoux · Jan 24, 2025
Usage :

source('https://forgemia.inra.fr/-/snippets/205/raw/main/biom2phyloseq.R') biom2physeq(biomfilename = "proj.biom1", metafilename = "proj_data-table.csv", rename_file = "proj_rename.csv", col_types = "cfD") |> saveRDS("proj.RDS")

Usage : ```r source('https://forgemia.inra.fr/-/snippets/205/raw/main/biom2phyloseq.R') biom2physeq(biomfilename = "proj.biom1", metafilename = "proj_data-table.csv", rename_file = "proj_rename.csv", col_types = "cfD") |> saveRDS("proj.RDS") ```

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